蛋白质组学（Protemics）一词，源于蛋白质（Protein）与基因组学（Genmomics）两个词的组合，意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的疾病发生、细胞代谢等过程的整体而全面的认识。

蛋白质组学研究不仅是探索生命奥秘的必须工作，也为人类健康事来作出巨大贡献。